在硕士论文检测中，误判可能源自系统算法的不完善性、文本相似度高导致的误判、学术规范理解的差异等多方面原因。学生可通过向学校提交申诉材料，提供相关证据进行申诉，要求重新评估论文原创性。

申诉流程一般包括学生书面申诉、学校成立申诉处理小组进行初审、复核论文原创性、最终给出申诉结果等步骤。学生在申诉过程中应理性对待，提供充分的证据和论据，维护自身合法权益。