硕士论文中合作作者不端行为的识别方法主要包括：1.比对文献：通过比对文献，查找是否存在重复发表等情况；2.审查数据：仔细审查数据，查看是否有不合理的数据重复或造假现象；3.关注作者贡献度：关注合作作者在研究中的贡献度，是否符合实际情况；4.利用软件工具：借助专业软件工具进行数据分析和比对，发现不端行为的痕迹。

在硕士论文中，识别合作作者的不端行为是非常重要的。除了上述方法外，还可以采用网络检测技术，对文献进行全面检索，查找是否有抄袭等情况；同时，建立严格的作者署名规范，明确每位作者的具体贡献，避免不端行为的发生；此外，定期组织学术道德讲座，加强学术诚信教育，提高学生和导师的道德水平，共同维护学术规范和秩序。